小麥全蝕病的病菌要來源于殘存在土壤里的帶菌根茬以及稠濁有病根、病莖、病葉鞘等殘體的糞肥、種子三種途徑。因此，操控病害有必要做到維護無病區，封閉零散病區，壓低老病區病況;量體裁衣，實行輪作倒茬，增施有機肥、磷鉀肥，選用耐病豐登品種，深翻倒土;輔助于藥劑拌種是防病的重要措施。

　　1 輪作倒茬

　　全蝕病隨寄主作物復種指數和輪作次數的添加逐年加劇，而與非寄主作物(如蔬菜、棉花、蔥蒜等)輪作1~2年的麥田，病況顯著減輕。選用沉痾田大輪作，輕病田小換茬。詳細是沉痾田栽培小麥1年以上，改種蔬菜、棉花、油菜等作物;輕病田小麥收成后，復種花生、大豆、蔥、白菜、蘿卜等非寄主作物。

　　2 堅持五改

　　2.1 改低茬收割為高茬收割 全蝕病病菌侵染部位僅限于小麥根部和莖基部15cm以下。高茬收割可有用操控種子間殘體帶菌。收割后及時鏟除田間麥茬，集中處理;

　　2.2 改常溫漚肥為高溫發酵滅菌漚肥 因為常溫漚肥不能使病菌逝世，將很多病菌帶入田間，擴展發病面積。而經高溫發酵滅菌處理后的糞肥，病菌存活率為0。高溫發酵滅菌辦法：在“大暑”前后，把麥糠與水拌均，堆在平地上，堆高2~3m，長寬不限，外表加蓋塑料薄膜，經1~2天，堆溫可達50℃以上，發酵3天后即可拆垛用于基肥，扒垛時，將附近及堆底半尺厚發酵溫度缺乏40℃的麥糠扒開，從頭堆積發酵。

　　2.3 改自留種為購良種 麥田病麥與無病麥混合收割脫粒時，種子間夾藏很多病體殘屑。而規范種子出產部門出產的良種，經嚴厲精選，無雜質，杜絕了病菌傳達。
 
　　2.4 改淺耕為深翻 實踐證明，深翻50~60cm可使小麥全蝕病白穗率降低80%以上，深翻后，需增施有機肥提高土壤肥力。

　　2.5 改單一上肥為配方上肥 合理搭配肥料，培肥地力，促進小麥健壯成長也是防治該病的一項重要措施。

　　3 增施有機凈化肥

　　麥田禁止施用未經高溫處理土糞、麥糠、秸稈等，避免病菌隨土糞分散。

　　4 藥劑處理

　　4.1 土壤處理 播前可運用70%甲基托布津每畝2~3kg加細土20~30kg均勻施入耕種行間處理土壤。

　　4.2 藥劑拌種 可選用3%敵萎丹400~600ml拌種子100kg或2.5%適樂時200m1拌種子100kg有較好防效。

　　4.3 灌根 小麥返青期，施用蝕敵或消蝕靈每667m2 100~1500ml對水150kg灌根。